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ⓘ PICRUSt




                                     

ⓘ PICRUSt

PICRUSt 是一个生物信息学软件包。 该名称是" Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States”(隐性状态重建进行菌群进化研究) 的缩写 。

该工具可用于宏基因组分析,该工具可以基于一个或更多样品的标志基因的调查推断出来的微生物的社会功能的配置文件。 PICRUSt基本上是采用一个用户提供的奥图表,该表显示了标记基因序列的最常见的是16战斗机群,在每个样品的相对丰度。 PICRUSt输出是根据基因的功能最基质取样的,样品,给出每个研究样品中的功能基因数。 PICRUSt估计的指定的样本可以遗传图谱的能力取决于一些已知的测序的基因组。 这也可以被认为是使用自动化,而不是手研究可能存在16S核糖体RNA子库序列的生物体中存在的基因家庭。

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